员工不听上司的，绝大部分情况都是因为上司无法决定甚至影响员工的利益。也可以理解为上司没有实权。
以下从主动和被动两个角度分析一下员工的服从度和什么因素相关以及如何受影响。
第一种情况：被动服从——利益被掌控。
当上司拥有员工的利益决定权——比如能否加薪、有无奖金、排班安排、请假批准、加班要求、培训机会、升迁推荐、以及是否参与重要项目等等——员工的未来很大程度上掌握在上司手里。上司掌控的面越广，员工的服从度越高，因为员工利益和上司认可高度挂钩。反之，如果不听上司的指令没有任何实质性的后果，员工自然不会太把上司当回事。以上是职场中员工是否服从上司的核心逻辑。
第二种情况：主动服从——心服口服。
员工也可能被上司的魅力所折服，对上司言听计从。
上司身上的光环往往来自两个方面：专业能力与人格特质。如果上司的专业能力足够强，或者为人处事让人如沐春风，身上就有了魅力，员工可能会心甘情愿地听从调遣。但这种服从性会随着员工的成长而变化，极不可靠。
总而言之，权力和威望都能让员工服从，但起决定性作用的永远是前者，后者只能锦上添花。
最后说点“题外话”。如果在一个机构里面，上司对于下属不服从自己没有什么办法，这个单位的管理肯定是有问题的。如果发现单位有问题，尽快评估一下值不值得留。充满歪风邪气的组织，如同一个大染缸，在里面不但学不到东西，连人的底色都变了。